Se inició está fundación en 1874 con dos monjas del Carmelo de Bogotá que habían regresado de su exilio en España, habitando al principio una casa cercana a la Iglesia de Santa Rosa y pasando luego a ocupar el Monasterio que se levantó al lado de la Ermita.
La comunidad de Bogotá asumió la fundación destinando cuatro religiosas.
Fue inagurada oficialmente el 11 de Marzo de 1904, dedicándola a la Santísima Trinidad y bajo la jurisdicción del Arzobispo de Popayán, hasta la creación de la diócesis de Cali.